חשוב לקבל הנחיות מדויקות במכון שבו מתקיימת הבדיקה. אלו הן ההנחיות הכלליות שכדאי להכיר:
בשל השימוש בטכנולוגיה מבוססת תהודה מגנטית, יש ליידע את הרופא ואת צוות הבדיקה בנוגע לקיומם של רסיסי מתכת או מכשירים מתכתיים בגוף, לפני ביצוע הבדיקה. בחלק מהמקרים יוחלט שלא לבצע את הבדיקה על רקע זה.
יש להסיר כל מכשיר מתכתי שניתן להסרה, כמו תכשיטים, חגורה וכו'.
לא ניתן לקיים את הבדיקה במהלך הווסת, ויש לבצעה בתזמון ספציפי במהלך המחזור החודשי – בין היום השביעי ליום הארבעה-עשר מתחילת המחזור. לכן, יש להתאים את מועד הבדיקה באופן אישי.
בדרך כלל יש צורך בצום של שעתיים לפחות לפני הבדיקה – יש לוודא מול מכון הבדיקות.
יש ליידע את הצוות במידה והנבדקת סובלת מקלסטרופוביה או חשש משמעותי לקראת ביצוע הבדיקה בתוך מכשיר סגור. במקרים חמורים ניתן להיעזר בחומרי הרגעה, בייעוץ הצוות הרפואי בלבד.